تقع كلية الطب البشري في مباني الجامعة العربية الامريكية فلسطين في محافظة جنين ومحافظة رام الله، والمبنى الرئيسي لها في مدينة جنين وتبلغ مساحة المجمع الطبي في حرم جنين والذي يشمل كلية الصيدلة وكلية الطب حوالي 7566م²، وفي رام الله يتوفر مساحة 500 م2 وعدد من القاعات الدراسية والمختبرات التعليمية.

كما تستفيد الكلية من العديد من المباني والمرافق الخاصة والمساندة للتعليم في كلية الطب إضافة الى  طابق في مستشفى جنين الحكومي للتعليم السريري.